生活汙水、醫院汙水以及屠宰肉類加工等汙水，含有各類病毒、細菌、寄生蟲等病原微生物，流入水體會傳播各種疾病。如受到生活性和病原菌汙染而引起霍亂、傷寒、脊髓灰質炎、甲型病毒性肝炎等，它們通過水傳播而暴發流行傳染病，危害大且持續時間長。在19世紀和20世紀前期發生過幾次嚴重事件。如泰晤士河在1836～q#886年間，由于河水被汙染，曾給倫敦帶來四次霍亂流行，僅1849年一次就死亡q#4000人。德國漢堡1892年因飲用水中含有傳染病菌，使16000人得病，9000人死亡。1970年伏永加河口的城市阿斯特拉罕暴發霍亂病，其主要原因之一就是伏爾加河水質受到汙染。1998年我國上海地區也暴發過因食用受到水汙染的毛蚶而得甲型肝炎的事件，傳染面積廣，受害人多，僅上海一地就有30多萬人感染，影響極大。
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