1.投加量
消毒效果與消毒劑的投加濃度和接觸時間成正比，因此控制和影響消毒效果的主要因素是消毒劑的投加量和接觸時間。消毒劑的投加量與接觸時間的乘積可以反映消毒劑的效果，一般這個乘積值越小，說明該消毒劑的效率越高。比如臭氧達到某種消毒效果要求投加量與接觸時間的乘積是5的話，要達到同樣效果，二氧化氯和氯的投加量與接觸時間的乘積分別是120和 [#]44??對于某種汙水進行消毒處理時，加人較大劑量的消毒劑無疑會得到更好的消毒效果，但同時必然造成運行費用的增加。因此需要確定一個適宜的投藥量，既能滿足消毒殺菌的指標要求，又能使運行費用較低。在有條件的情況下，可以通過試驗的方法來確定消毒劑的投加量。但在大多數情況下，可以根據經驗數據來確定消毒劑的投加量和反應接觸時間，並根據實際情況進行適當調整。
2.水質
一般說來，溫度越高，同樣消毒劑投加量情況下消毒效果會更好些。汙水水質越複雜對消毒效果影響越大。特別是當水中含有較高濃度的有機汙染物時，由于有機物不僅能消耗消毒劑，而且還能在菌體細胞外壁形成保護膜或隱蔽細菌，阻止其與消毒劑接觸，因而造成消毒效果大大下降。
3.pH值
汙水pH值的變化對采用加氯消毒的效果影響很大，一般要求pH值在6.5-7.5之間，pH值升高會使消毒效果下降，使用中應予以適當的考慮。
4.混合形式與接觸方法
混合形式與接觸方法控制主要對以傳質控制的消毒過程有較大的影響，消毒劑投加點水流必須是高度紊流，能快速完成消毒劑與水的混合過程，尤其是采用臭氧消毒時，必須考慮選擇有效合理的接觸反應設備和裝置。
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